Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01878 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01878 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01878 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01878 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01878 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01878 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01878 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01878 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01878 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01878 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01878 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms