Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01648 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01648 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01648 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01648 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01648 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01648 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01648 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01648 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01648 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01648 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms