Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccl20O89093 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl20O89093 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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