Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col5a1O88207 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a1O88207 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col5a1O88207 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col5a1O88207 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a1O88207 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms