Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SfnO70456 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SfnO70456 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SfnO70456 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SfnO70456 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SfnO70456 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms