Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1bO55017 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1bO55017 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms