Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pole2O54956 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms