Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CrxO54751 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms