Protein–RNA interactions for Protein: O54718

Irs3, Insulin receptor substrate 3, isoform CRA_a (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irs3O54718 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irs3O54718 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms