Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rem1O35929 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rem1O35929 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms