Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms