Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timm44O35857 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Timm44O35857 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Timm44O35857 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Timm44O35857 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timm44O35857 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms