Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc1a6O35544 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms