Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1dO35473 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1dO35473 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1dO35473 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1dO35473 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1dO35473 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1dO35473 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1dO35473 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1dO35473 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1dO35473 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1dO35473 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1dO35473 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms