Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2O35245 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2O35245 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms