Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms