Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ArxO35085 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ArxO35085 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArxO35085 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArxO35085 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms