Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap23O09044 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap23O09044 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snap23O09044 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap23O09044 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap23O09044 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms