Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MttpO08601 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MttpO08601 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MttpO08601 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms