Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MsmbO08540 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms