Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c2J3QNM1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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