Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20873J3QMQ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20873J3QMQ9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms