Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930544D05RikJ3QK56 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms