Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm21411J3KMS0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm21411J3KMS0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm21411J3KMS0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21411J3KMS0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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