Protein–RNA interactions for Protein: J3KMM7

A630095N17Rik, RIKEN cDNA A630095N17 gene, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630095N17RikJ3KMM7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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A630095N17RikJ3KMM7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A630095N17RikJ3KMM7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A630095N17RikJ3KMM7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A630095N17RikJ3KMM7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A630095N17RikJ3KMM7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A630095N17RikJ3KMM7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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A630095N17RikJ3KMM7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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A630095N17RikJ3KMM7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A630095N17RikJ3KMM7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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