Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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