Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20696H3BJN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20696H3BJN7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms