Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm29394H3BIW7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm29394H3BIW7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms