Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933406M09RikG3XA12 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms