Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r167G3UW71 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r167G3UW71 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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