Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm8444F6XS56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8444F6XS56 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms