Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21876F6XK35 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21876F6XK35 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms