Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10477F6SW83 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10477F6SW83 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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