Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6S4

Gm17067, Predicted gene 17067, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17067E9Q6S4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17067E9Q6S4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17067E9Q6S4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17067E9Q6S4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17067E9Q6S4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17067E9Q6S4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm17067E9Q6S4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm17067E9Q6S4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm17067E9Q6S4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms