Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700024B05RikE9Q6D7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700024B05RikE9Q6D7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms