Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FancfE9Q5Z5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms