Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc17E9PVB5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms