Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms