Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12cD3Z3L3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim12cD3Z3L3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms