Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms