Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif28pD3YXS5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif28pD3YXS5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms