Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd1D3YXK1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms