Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn24D3YXJ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms