Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pnldc1B2RXZ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pnldc1B2RXZ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms