Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah3B2RWG3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms