Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34b1B1AZQ8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms