Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmem238A9JSM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms