Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xlr4aA2BI40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xlr4aA2BI40 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms