Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Frmpd4A2AFR3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Frmpd4A2AFR3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms