Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pramef6A2A8M8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef6A2A8M8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms